李亦学研究员

教育经历
1978.02-1982.02,新疆大学,物理,本科
1984.09-1987.07,新疆大学,理论物理,硕士
1992.10-1996.10,海德堡大学,理论物理,博士
 
工作经历
1996.10-1997.02,斯图加特大学,博士后
1997.02-2000.06,欧洲分子生物学实验室,博士后
2000.06-2002.12,中国科学院上海生命科学研究院,副研究员
2002.12-2006.12,中国科学院上海生命科学研究院,研究员
2002.02-2023.12,上海科学院上海生物信息技术研究中心,主任
2007.01-2015.12,中国科学院上海生命科学研究院,研究员
2007.01-2017.12,上海交通大学生命科学与技术学院生物统计学与生物信息学系,系主任
2015.12-2020.12,中国科学院上海营养与健康研究所,研究员
2021.01-2021.04,生物岛实验室,研究员
2021.04至今,广州实验室,研究员
 
研究简介
李亦学的研究方向致力于将数理基础、人工智能技术与生命科学相融合,专注于计算生物学方法和生物信息学研究体系创新与技术研发。李亦学基于生命进化理论,开展多项应用于病毒、细胞和动物的比较基因组学研究;在基因编辑脱靶效应识别与临床应用优化工作中主持数据建模分析工作,取得突破性成果;构建数理模型和生物信息学分析工具集,支撑不同生命调控过程的解析与新冠病毒进化网络的构建。此外,李亦学主持开发生物医学大数据操作系统“Bio-OS”,以降低临床科研计算复杂度,支撑“智慧医疗数据密集型科研”范式的推广,为广大生物医学科学研究人员提供更为便利的生物医学大数据学习和分析平台。
 
人才头衔与荣誉奖励
1. 全国五一劳动奖章
2. 上海市科教兴市领军人才
3. 上海市劳动模范
4. 广州市黄埔区优秀人才(创新)
5. 上海市自然科学一、二等奖(排名第一)
6. 教育部自然科学一等奖(排名第五) 
6. 中国科协“生命科学2019年十大进展”
 
代表性成果
1. Lu Li, Lei Cui, Ping Lin, Zhaoyuan Liu, Shujie Bao, Xiaolong Ma, Haitao Nan, Wencheng Zhu, Jin Cen, Yunuo Mao, Xiong Ma, Lingyong Jiang, Yu Nie, Florent Ginhoux, Yixue Li*, Hong Li*, Lijian Hui*, Kupffer-cell-derived IL-6 is repurposed for hepatocyte dedifferentiation via activating progenitor genes from injury-specific enhancers,Cell Stem Cell, 30,1-17(2023).
 
2. Erwei Zuo , Yidi Sun , Tanglong Yuan , Bingbing He , Changyang Zhou , Wenqin Ying , Jing Liu , Wu Wei , Rong Zeng , Yixue Li*,Yang H*, A rationally-engineered cytosine base editor retains high on-target activity while reducing both DNA and RNA off-target effects, Nature Methods,17,pages600–604(2020). 
 
3. Qiu Z, Li H, Zhang Z, Zhu Z, He S, Wang X, Wang P, Qin J, Zhuang L, Wang W, Xie F, Gu Y, Zou K, Li C, Li C, Wang C, Cen J, Chen X, Shu Y, Zhang Z, Sun L, Min L, Fu Y, Huang X, Lv H, Zhou H, Ji Y, Zhang Z, Meng Z, Shi X*, Zhang H*, Li Y*, Hui L*. A Pharmacogenomic Landscape in Human Liver Cancers. Cancer Cell;36(2):179-193(2019).
 
4. Zhou C, Sun Y, Yan R, Liu Y, Zuo E, Gu C, Han L, Wei Y, Hu X, Zeng R, Li Y*, Zhou H*, Guo F*, Yang H*. Off-target RNA mutation induced by DNA base editing and its elimination by mutagenesis. Nature;571(7764):275-278(2019).
 
5. Erwei Zuo, Yidi Sun, Wu Wei, Tanglong Yuan, Wenqin Ying, Hao Sun, Liyun Yuan, Lars M. Steinmetz*, Yixue Li*, Hui Yang*,Cytosine base editor generates substantial off-target single nucleotide variants in mouse embryos,Science,364(6437):289-292(2019).
 
6. 基于元基因组学的未知病原快速鉴定系统及分析方法,中国,ZL201110452666.7,2017年2月8日,2.
 
7. 一种利用跨物种相似性的元分析方法,中国,ZL201110126461.X,2015年11月25日,1.
 
8. 李亦学,张力建,《肿瘤与基因》,北京科学技术出版社,2022,北京。
 
9. 赵国屏、李亦学、陈大明、熊燕,《生物医学大数据的态势与展望》,发表于《中国科研信息化蓝皮书2020》第一章,电子工业出版社,2020,北京。
 
10. 李霞,李亦学,廖飞《生物信息学》,人民卫生出版社,2010,北京。